Outils Bioinformatiques

Biopuces

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Sélection des sondes

Ensemble d'outils développés ou co-développés par le CIB permettant de sélectionner des sondes (fragments d'ADN, clones, oligo)

Traitement des données

• Référence d'outils : référence d'outils de normalisation, clustering et data-mining pour l'analyse des données.
• WLPT@DNA-ARRAY : un outil de gestion, de visualisation et de navigation des données biopuces par des arbres.

Base de données Biopuces

Base de données développée par le CIB. Il s'agit d'une adaptation de BASE (BioArray Software Environment) pour la génopole de Lille

Archives des plug-ins de BASE 1.2.x

BASE permet l'analyse des données intégrées dans la plate-forme sous forme de modules appelés "plug-ins". Ce lien vous donne la possibilité de télécharger les archives stockées par le CIB. Attention, certains "plug-ins" ne sont pas validés par les développeurs de la plate-forme BASE, d'autres peuvent ne pas être à jour.

Forum francophone dedié à BASE

Forum francophone dédié à l'utilisation et aux développements informatiques de BASE (BioArray Software Environment). BASE est une plate-forme web spécialisée dans la gestion et le stock age des expériences de puces à ADN (normes MIAME). Ce forum à pour objectif d'aider les nouveaux util isateurs et de regrouper les principaux développements qui transitent autour de cette plate-forme. Venez participer aux discussions et à l'enrichissement de cette communauté

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